PacBioシーケンシングシステム
長年にわたる最先端の研究開発に基づき、当社のシステムは、研究者の皆様による世界を変えるような新発見のお手伝いを可能にします。 当社のロングリードおよびショートリードシーケンスシステムの比類ない精度をご覧ください。
REVIO システム
ロングリードシーケンス
SPRQケミストリーを搭載したRevioシステムは、SMRTセルあたり120 Gbを提供し、大規模プロジェクトに最適です。完全に自動化されたワークフローは、最大4つのSMRTセルを同時に実行し、効率とスループットを最大化します。
VEGA システム
ロングリードシーケンス
Vegaベンチトップシステムは、SMRTセルあたり60 Gbを提供し、スピードとシンプルさを重視するラボに最適です。ユーザーフレンドリーなインターフェースとシングルSMRTセル構成により、合理的で迅速なシーケンシングを完全にコントロールできます
ONSO システム
ショートリードシーケンス
シーケンシング・バイ・バインディング（SBB）ケミストリーを搭載したOnsoシステムは、Q40精度が90%という画期的なショートリード性能を実現します。この15倍の精度向上により、希少バリアントの検出感度が向上し、サンプルあたりのコストが削減されます。
アプリケーションブリーフ
1個のSMRT Cellで何かできるか?
- より完全なゲノムを作成し、より多くのバリアントタイプ、全長転写産物、メタゲノム、メチル化を検出できます。
- HiFiの卓越した精度(90%以上の塩基がQ30+)が、あなたのプロジェクトにより良い結果をもたらします。
- BAM形式に自動変換を備えた装置内の一次解析により、迅速な解析につながります。
アプリケーション
ターゲットまたは全ゲノムシーケンス、複雑な集団の研究、アイソフォームやエピジェネティック修飾の発見など、PacBioシーケンスはお客様の研究を向上させ、競争優位をもたらします。
全ゲノムシーケンス
全ゲノムシーケンス（WGS）は、ヒト、植物、動物、微生物を問わず、生物のDNA全体を評価します。HiFiシーケンスは、反復配列領域や高GCの多い領域においても、最大25kbの1分子リードから偏りのない99.9%のリード精度（Q30）で完全かつ正確な分解能で全ゲノムシーケンス情報を取得します。
ターゲットシーケンス
ターゲットシーケンスでは、ゲノム中の最も到達しにくい領域であっても、様々なバリアントタイプを正確に検出し、その理解を深めることができます。当社のターゲットシーケンスアプリケーションは、HLAシーケンスを含む、ヒトの生物医学研究、植物および動物科学、微生物学および感染症におけるアプリケーションに適しています。
RNA シーケンス
長くて正確なHiFiリードを用いたIso-Seq法による全長転写産物シーケンスでは、転写開始点と終了点の確認、スプライシングイベントの解析、アレル特異的アイソフォームの特定、アイソフォームレベルの分解能での発現プロファイル、融合遺伝子の検出、オープンリーディングフレームの全長予測など他のシーケンサーでは見過ごされる可能性のある新しい生物学的特性を見出すことが可能となります。
エピジェネティクス
HiFi シーケンスのユニークなケミストリーは、サンプルのエピジェネティック変化を直接的に捉えることを可能にします。メチル化検出を含む“5塩基HiFiシーケンス”により、研究者は同じシーケンスライブラリから遺伝子活性やその他の生物学的機能に関連するゲノム全体のメチル化パターンを特定することができます。
メタゲノムシーケンス
微生物群集がどのように機能し、また、環境と相互作用しているかについての新たな知見を得るためには、より優れたアプローチを必要とします。長くて正確なHiFiリードは、種レベルの分解能をもつ完全長16Sシーケンス、個々の遺伝子の機能解析を含むメタゲノムプロファイリングやそのアセンブリを可能とします。
ロングリードHiFi シーケンシングで深まる ゲノムへの理解（eBook）
このeBookは、ゲノミクスの分野で実績のある上級者の方から初心者の方まで、誰にも役立つ簡潔かつ包括的なテキストです。ロングリードシーケンスについて、重要かつ基本となる概念を分かりやすく解説することによって、将来の研究プロジェクトへの参考としてお役立ていただけます。
シーケンス技術
HiFiリードとは何か?
HiFi リードは、PacBio ロングリードシステムのcircular consensus sequencing (CCS) mode を用いて作成されます。HiFiリードは、1分子リード精度 99.9%の塩基レベルの解像度を提供します。
HiFiリードは、de novoアセンブリのための全ゲノムシーケンス、包括的なバリアント検出、エピジェネティックな特性評価、RNAシーケンスなど、幅広いSMRTシーケンスアプリケーションで使用することができます。
Kinnexとは何ですか？
KinnexキットはMAS-Seq法に基づくもので、スループット向上を目的として小さなアンプリコンを大きなフラグメントライブラリーに連結します。
Kinnexキットは、PacBioロングリードシーケンスシステム上での、全長RNA、シングルセルRNA、16S rRNAシーケンスのスループットを向上させ、ショートリードRNAシーケンスでは達成困難な、より優れた分解能での大規模研究を可能にします。
5塩基HiFi シーケンスによるDNAメチル化測定
同じライブラリーから、ゲノムワイドに遺伝的およびエピジェネティックなバリアントを検出し、ハプロタイプフェージングを行います。同一サンプルのHiFiシーケンスにより、転写開始点でのハイパーメチル化を含む、ゲノム全体のメチル化パターンを検出します。複数サンプルのシーケンスにより、メチル化の違いを特定します。
HIFIの違い - 大規模で高品質なデータを、ALL OF US へ
HiFiリードは、小さなバリアントと大きなバリアントの両方で最も正確な結果を出しました。”そして、ロングリードは、All of Usや潜在的に他の多くのプロジェクトで最も完全で正確なバリアントコールを確立するために広く評価されています。”と彼は言います。
プレスリリース
これらのプレスリリースは翻訳されています。全てのリリースは ALL press releases (in English) をご覧ください
- Application brochure – HiFi reads for highly accurate long-read sequencing (日本語）
- Human genomics overview brochure (日本語）
- Application Brief – Variant detection using whole genome sequencing with HiFi reads best practices (日本語）
- Application note – MAS-seq (日本語）
- Application brief – Measuring DNA methylation with 5-base HiFi sequencing (日本語）
- Sequencing 101: Long-read sequencing
サポートコンテンツ
私たちの最優先事項の一つは、現在そして未来のお客様の新たな科学的発見ために必要なツールを提供することです。PacBioでは、あらゆるレベルの研究活動を支援するための幅広いリソースをお客様をサポートするために提供しています。
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